È possibile isolare i server di telefonia di Communication Manager dal resto della rete aziendale per proteggerli da virus, worm, attacchi Denial of Service (DoS, Rifiuto del servizio) e di altro tipo. Communication Manager utilizza un numero minimo di porte per accesso ai servizi in modo da ridurre la vulnerabilità agli attacchi molesti. Impiega la codifica tra server, gateway e terminali al fine di proteggere lo streaming vocale ed i canali di segnalazione.